Системите за чиста вода се разделят главно на системи за обратна осмоза, йонообменни системи, системи за електродейонизация (EDI) и системи за ултрафилтрация. Различни системи са подходящи за лабораторни, индустриални или домакински приложения в зависимост от техния процес и качеството на отпадъчните води.
Често срещаните типове, базирани на технологията на приложение и пречистване, са следните:
Система за обратна осмоза (RO): Премахва над 95% от йони, органична материя, бактерии и прахови частици чрез полу-пропусклива мембранна филтрация, произвеждайки чиста вода степен III (RO вода). Широко използван за основно лабораторно почистване, изплакване на стъклени съдове и като стъпка за предварителна обработка на вода с висока-чистота.
Йонообменна система: Използва функционални йони върху смолата за обмен с йони като калций, магнезий и натрий във водата, като ефективно премахва йоните на твърдостта и разтворените соли. Често се използва в етапа на фина обработка за подобряване на чистотата на водата.
Система за електродейонизация (EDI): Комбинира технологии за електродиализа и йонообмен, като непрекъснато премахва йони от водата под електрическо поле с постоянен ток. Не е необходима химическа регенерация. Може стабилно да произвежда чиста вода от степен II или дори ултрачиста вода от степен I, подходяща за индустрии с висок-стандарт като електроника и фармацевтика.
Ултрафилтрационните системи използват ултрафилтрационни мембрани за отстраняване на големи органични молекули, пирогени и микроорганизми, като същевременно запазват някои минерали. Те обикновено се използват в експерименти в областта на науката за живота за приложения, чувствителни към RNase/DNase.

